Meist funktioniert dies nur, wenn man mit Zugriffsberechtigungen hantiert. Heißt, nicht jeder darf neue Ordner anlegen oder löschen.
Bei uns sieht es in etwas so aus (stark reduzierter Ausschnitt):
QMM/
/QMM2
/System Dokumentation
/SAP Dokumentation
/QMM5
/Lieferanten
etc...
So hat die Abteilung QMM einen festvorgebenen Baum und nur die Kollegen aus z.B. QMM2 können in QMM2 ablegen. Alle anderen haben nur Leseberechtigungen. Kollegen, die wie ich ausschließlich Projektarbeit leisten, haben überall kompletten Zugriff.