Der Rest dürfte in versteckten Dateien und Ordnern liegen.
Die größte Speichermenge wird üblicherweise vom persönlichen Ordner "Library" verbraucht, der erst dann gezeigt wird, wenn Du das in den Darstellungsoptionen für Deinen Privatordner einschaltest.
Darüberhinaus haben die meisten Benutzer noch einige Dateien, die mit einem Punkt beginnen und deshalb grundsätzlich versteckt sind, direkt auf der obersten Ebene ihres Privatordners. Die verbrauchen in der Regel nur wenig Platz, können aber sehr wichtige Daten enthalten und sollten deshalb nicht gelöscht werden.